符合规定条件的公司变更，客户可以对其交易中的股票支付部分，按照下列规定进行特殊税务处理。股权收购、收购企业购买的股权在被收购企业全部股权的50%以上，并且收购企业发生收购该股权时的股权支付金额在其交易支付总额的85%以上，可以选择按照下列规定处理。

1、被收购企业的股东取得被收购企业所有权的税收订正算法的基础，并在被收购所有权原来的税收订正算法的基础上确定。

2、收购企业取得被收购企业所有权的税务订正算法的基础，并在被收购所有权原来的税务订正算法的基础上确定。

3、收购企业、被收购企业原有各项资产和负债的纳税核算基础和其他相关所得税事项不变。

资产收购、公司变更者收购的资产占全部资产的50%以上，且发生收购该资产时的支付股份额占其交易支付总额的85%以上，可以选择按照下列规定办理：

1、取得被公司变更者所有权的税项核算基础，在被转让资产的原税项核算基础上确定。

2、取得公司变更者资产的税收订正算法的基础，在被转让资产原来的税收订正算法的基础上确定。

3、合并企业接受被合并企业的资产和负债的税收订正计算的基础，在被合并企业原来的税收订正计算的基础上确定。

4、被合并企业合并前的相关所得税事项由合并企业接管。

以上就是公司变更时处理股票的方法介绍，感谢阅读。